Fakultas Farmasi Universitas Hasanuddin telah menyelenggarakan program pendidikan sarjana (S1) farmasi sejak tahun 1963. Fakultas Farmasi resmi berdiri pada tanggal 14 November 2007 setelah sebelumnya merupakan jurusan dalam Fakultas MIPA dan merupakan fakultas ke-14 dalam lingkup Universitas Hasanuddin. Dalam penilaian akreditasi program studi oleh BAN DIKTI Depdiknas pada tahun 2006, program studi farmasi Fakultas Farmasi Universitas Hasanuddin mendapatkan akreditasi A.

Fakultas Farmasi Universitas Hasanuddin mengembangkan ilmu sains farmasi dan ilmu sains terapan untuk profesi apoteker dan teknologi laboratorium kesehatan. Fakultas Farmasi terdiri atas Program Studi S1 Farmasi, Program Studi S2 Farmasi, Program Pendidikan Profesi Apoteker (P3A), dan konsentrasi Teknologi Laboratorium Kesehatan (TLK). Program kelas paralel dibuka sejak tahun 1997 dan konsentrasi TLK sejak tahun 2005. Saat ini jumlah mahasiswa Fakultas Farmasi Universitas Hasanuddin telah mencapai sekitar 1500 orang.